El Laboratorio MetPro fue creado en mayo del 2019 con el objetivo de contribuir al desarrollo de la ciencia en México al ofrecer análisis metabolómicos y proteómicos especializados por espectrometría de masas de alta resolución. Es de nuestro particular interés poner a disposición de los investigadores mexicanos herramientas analíticas e informáticas que permitan acelerar el descubrimiento de nuevos compuestos (p. ej. productos naturales y derivados de microbios), mecanismos celulares que contribuyen al desarrollo de patologías y descubrimiento de biomarcadores de diagnóstico y pronóstico.
Nuestro laboratorio se especializa en proteómica cuantitativa de tipo SWATH y análisis metabolómicos no dirigidos.
Nuestro laboratorio posee dos espectrómetros de masas híbridos (cuadrupolo-tiempo de vuelo) de alta resolución:
1. TripleTOF 5600+ (AB Sciex), con fuentes de ionización por electrospray (ESI) e ionización química a temperatura ambiente (APCI).
2. 6530 Accurate Mass Q-TOF (Agilent) con fuente de ionización por nanospray, ESI y APCI.
Cromatografía de líquidos El espectrómetro de masas Triple TOF 5600+ está acoplado a un cromatógrafo de líquidos Eksigent nanoLC® 400 system (AB Sciex) que ofrece varios rangos de flujos: 100-1000 nL/min, 1-10 µL/min y 5-50 µL/min.
El espectrómetro de masas 6530 está acoplado a un cromatógrafo de líquidos Agilent 1260 con una interface CHIP Cube que ofrece comúnmente un flujo de 300 nL/min.
Dependiendo el tipo de muestra y (tejido, células en cultivo, etc. ) y análisis, utilizamos métodos comerciales o estandarizados por nosotros para el procesamiento de la muestra.
Para estudios proteómicos tipo bottom-up, empleamos mediciones a nivel de proteínas y péptidos durante el procesamiento de la muestra. No utilizamos Nanodrop ya que no ofrece una buena precisión ni exactitud para la determinación de péptidos trípticos.
Hilda Carolina Delgado de la Herran, et al., Formation of multinucleated variant endothelial cells with altered mitochondrial function in cultured coronary endothelium under simulated diabetes. bioRxiv. 2019. doi: 10.1101/622407
Moreno-Ulloa, Aldo, et al., Metabolic and metagenomic profiling of hydrocarbon-degrading microorganisms obtained from the deep biosphere of the Gulf of Mexico. bioRxiv. 2019. doi: 10.1101/606806.
Rubio-Elizalde I, et al., Scaffolds based on alginate-PEG methyl ether methacrylate-Moringa olefeira-Aloe vera for wound healing applications. Carbohydr Polym. 2019;15:455-467. doi: 10.1016/j.carbpol.2018.11.027
Allegra T. Aron Emily Gentry Kerry L. McPhail Louis Felix Nothias Mélissa Nothias-Esposito Amina Bouslimani Daniel Petras Julia M. Gauglitz Nicole Sikora Fernando Vargas Justin J. J. van der Hooft Madeleine Ernst Kyo Bin Kang Christine M. Aceves Andrés Mauricio Caraballo-Rodríguez Irina Koester Kelly C. Weldon Samuel BERTRAND Catherine Roullier Kunyang Sun Richard M. Tehan Cristopher A. Boya Christian Martin H. Marcelino Gutiérrez Aldo Moreno Ulloa Javier Andres Tejeda Mora Randy Mojica-Flores Johant Lakey-Beitia Victor Vásquez-Chaves Angela I. Calderón Nicole Tayler Robert A. Keyzers Fidele Tugizimana Nombuso Ndlovu Alexander A. Aksenov Alan K. Jarmusch Robin Schmid Andrew W. Truman Nuno Bandeira Mingxun Wang Pieter Dorrestein. (2019): Reproducible Molecular Networking Of Untargeted Mass Spectrometry Data Using GNPS. ChemRxiv. Preprint. doi:10.26434/chemrxiv.9333212.v1
Moreno-Ulloa A, et al., A pilot study on clinical pharmacokinetics and preclinical pharmacodynamics of (+)-epicatechin on cardiometabolic endpoints. Food&Function. 2018;9(1):307-319. doi: 10.1039/c7fo01028a
Barnett CF, et al., Pharmacokinetic, partial pharmacodynamic and initial safety analysis of (-)-epicatechin in healthy volunteers. Food & Function. 2015 Mar 11;6(3):824-33. doi: 10.1039/C4FO00596A
Departamento de Innovación Biomédica
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